Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rb1cc1Q9ESK9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms