Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms