Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MesdQ9ERE7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MesdQ9ERE7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MesdQ9ERE7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms