Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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