Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf1Q9EPU0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf1Q9EPU0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf1Q9EPU0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf1Q9EPU0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf1Q9EPU0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf1Q9EPU0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf1Q9EPU0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms