Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn1Q9EPL2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn1Q9EPL2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms