Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl4Q9DCU6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mrpl4Q9DCU6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl4Q9DCU6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms