Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE9

Igtp, Interferon gamma-induced GTPase, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IgtpQ9DCE9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
IgtpQ9DCE9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IgtpQ9DCE9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IgtpQ9DCE9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms