Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg9Q9DB90 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Smg9Q9DB90 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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