Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB05

Napa, Alpha-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapaQ9DB05 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapaQ9DB05 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapaQ9DB05 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapaQ9DB05 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapaQ9DB05 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NapaQ9DB05 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NapaQ9DB05 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms