Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms