Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700018B08RikQ9DA83 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700018B08RikQ9DA83 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700018B08RikQ9DA83 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms