Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smco2Q9DA21 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco2Q9DA21 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms