Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Actrt1Q9D9J3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms