Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D8N1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8N1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8N1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.3 ms