Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpl4Q9D8E6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms