Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af1Q9D883 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1Q9D883 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af1Q9D883 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms