Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AY761184Q9D848 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AY761184Q9D848 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms