Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tspan17Q9D7W4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan17Q9D7W4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms