Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms