Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtm5Q9D6G9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms