Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr42e1Q9D665 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sdr42e1Q9D665 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr42e1Q9D665 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr42e1Q9D665 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr42e1Q9D665 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr42e1Q9D665 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr42e1Q9D665 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr42e1Q9D665 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr42e1Q9D665 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr42e1Q9D665 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr42e1Q9D665 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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