Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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