Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms