Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrameQ9D4Z5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrameQ9D4Z5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms