Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Taf1dQ9D4V4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1dQ9D4V4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1dQ9D4V4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms