Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
4930556J24RikQ9D4U7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms