Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms