Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf3Q9D4H7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf3Q9D4H7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms