Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pabpc6Q9D4E6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc6Q9D4E6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms