Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D454 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D454 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D454 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D454 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D454 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D454 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D454 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D454 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D454 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D454 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D454 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D454 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D454 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D454 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D454 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D454 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D454 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D454 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D454 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D454 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D454 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D454 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D454 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D454 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D454 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D454 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D454 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D454 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D454 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D454 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D454 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D454 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D454 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D454 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D454 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D454 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D454 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D454 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D454 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D454 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D454 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D454 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9D454 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D454 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D454 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D454 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D454 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D454 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D454 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D454 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D454 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D454 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D454 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D454 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D454 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D454 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D454 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D454 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D454 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D454 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D454 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D454 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D454 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D454 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D454 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms