Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfap53Q9D439 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms