Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy3Q9D394 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy3Q9D394 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms