Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D2Q3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9D2Q3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9D2Q3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9D2Q3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9D2Q3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D2Q3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D2Q3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D2Q3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D2Q3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D2Q3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D2Q3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D2Q3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D2Q3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D2Q3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D2Q3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D2Q3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q9D2Q3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D2Q3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D2Q3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D2Q3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D2Q3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D2Q3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D2Q3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D2Q3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D2Q3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D2Q3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D2Q3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D2Q3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D2Q3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D2Q3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D2Q3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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