Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms