Protein–RNA interactions for Protein: Q9D260

9230112D13Rik, RIKEN cDNA 9230112D13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230112D13RikQ9D260 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9230112D13RikQ9D260 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
9230112D13RikQ9D260 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
9230112D13RikQ9D260 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9230112D13RikQ9D260 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
9230112D13RikQ9D260 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
9230112D13RikQ9D260 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9230112D13RikQ9D260 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
9230112D13RikQ9D260 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9230112D13RikQ9D260 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
9230112D13RikQ9D260 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms