Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SarnpQ9D1J3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SarnpQ9D1J3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms