Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl53Q9D1H8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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