Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cthrc1Q9D1D6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cthrc1Q9D1D6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cthrc1Q9D1D6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms