Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Hddc3Q9D114 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Hddc3Q9D114 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Hddc3Q9D114 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Hddc3Q9D114 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Hddc3Q9D114 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Hddc3Q9D114 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hddc3Q9D114 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Hddc3Q9D114 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Hddc3Q9D114 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Hddc3Q9D114 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Hddc3Q9D114 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Hddc3Q9D114 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Hddc3Q9D114 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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