Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lsm12Q9D0R8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lsm12Q9D0R8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lsm12Q9D0R8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lsm12Q9D0R8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lsm12Q9D0R8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lsm12Q9D0R8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lsm12Q9D0R8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lsm12Q9D0R8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lsm12Q9D0R8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms