Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc47Q9D024 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc47Q9D024 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms