Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms