Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl35Q9CZ49 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms