Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snf8Q9CZ28 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snf8Q9CZ28 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms