Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mis12Q9CY25 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mis12Q9CY25 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms