Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CXL3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CXL3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CXL3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CXL3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms