Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nip7Q9CXK8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nip7Q9CXK8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms