Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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