Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alpk1Q9CXB8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms